根据目前已有证据，还无法确认新冠病毒起源于哪里。具体分析如下：华南海鲜市场与疫情发源地的关联存疑武汉华南海鲜市场一度被认为是疫情发源地，但首批41例确诊病例中仅27例有该市场暴露史 ，且首例确诊患者无市场接触史 ，其家人也未出现症状。
新冠肺炎的源头尚未有定论，目前科学界主流观点认为病毒可能起源于自然界 ，但具体起源地和传播路径仍需进一步研究证实 ，民间各种未经证实的猜测和阴谋论缺乏科学依据 。科学界主流观点：病毒可能起源于自然界许多科学家认为新冠病毒可能起源于蝙蝠等野生动物，通过中间宿主传播给人类 。
我国社会大众认为此次病毒的源头来自于美国 ，及理由是：早前美国出现了一次造成大量死亡病例的“流感” ，怀疑这次“流感”实际就是新冠病毒肺炎，只是说法不同而已。而在去年10月举行的湖北世界军运会上 ，有5位美国运动员染病 ，怀疑美国有可能是故意定点投毒，或是无意携带病毒 ，导致该疾病在武汉大流行 。
全球范围分析检测出新冠病毒的时间越来越早新型冠状病毒最初是在武汉进行全面爆发的 ，所以当时国际上就会有一些人称，新型冠状病毒最早起源于中国武汉，但是随着时间的推移 ，越来越多的国家爆发出新冠病毒之后 。研究结果一再被推翻 ，各个国家检测出新冠病毒感染样本的时间越来越早。
新冠疫情在武汉爆发的原因，广泛接受的观点是 ，病毒的发源地是武汉的华南海鲜市场 。 病毒据信是从市场中的野生动物传播给人类的 ，这种观点得到了非典疫情类似情况的支撑 。 2003年的非典疫情就是通过果子狸传播给人类的，这一事实增加了上述解释的可信度。
气候因素：新冠病毒是一种喜冷厌热的病毒 。武汉位于中国的中部地区 ，冬季气温相对较低 ，这为新冠病毒的传播提供了有利的气候条件 。相比之下，广州等南方城市冬季气温较高 ，传染性相对较小。人群聚集与社交习惯：华南海鲜市场是武汉的一个重要市场 ，也是新冠疫情早期的主要传播场所之一 。
导致武汉市大规模爆发疫情的原因是新型冠状病毒（COVID-19）的传播 。武汉市作为疫情爆发的起点，有几个关键因素促成了疫情的大规模传播。首先 ，武汉市是一个人口密集的城市 ，拥有庞大的交通网络和商业活动，这为病毒的快速传播提供了便利条件。
1 、华南海鲜市场并非新冠病毒发源地，中科院团队通过基因追踪为溯源提供关键证据 。中国科学院西双版纳热带植物园的研究人员联合华南农业大学和北京脑科中心 ，基于93个新型冠状病毒样本的基因组数据 ，发现华南海鲜市场患者样品单倍型与更古老的外部样本存在演化关联，印证了病毒传入市场后扩散的推论 。
2、《科学》杂志报道武汉华南海鲜市场可能并非新型冠状病毒发源地 ，相关研究及观点认为病毒可能更早存在并从其他地方传播至此后引发大规模爆发 ，但该说法尚未完全证实。
3 、华南海鲜市场并非新型冠状病毒发源地，这一结论基于病例分析和基因组研究得出 ，科学家调查发源地旨在锁定传染源 、确认中间宿主、研究传播机制 ，为疫情防控提供科学依据 。